El obispo Gonzalo Duarte -quien además de haber sido obispo de Valparaíso fue obispo en el ejército- ha sido mencionado por varias víctimas como parte de una maquinaria de encubrimiento, donde las víctimas han acusado vista gorda en varios puntos de la Quinta Región. Consultado por los periodistas acerca de si hay una «cultura del encubrimiento» en el clero, Duarte respondió que “en la iglesia sí, pero parece que también en muchas otras instituciones”.